Le microbiote de la peau est constitué de milliards de micro-organismes, couvrant diverses espèces, vivant en communauté et étroitement liés à la santé de la peau.
De plus en plus, cette microflore est étudiée à l'aide de solutions génomiques qui ouvrent de nouvelles perspectives pour le développement de produits de soins cosmétiques et de traitements personnalisés pour les peaux atopiques. Grâce à son expérience et son savoir-faire, GenoScreen a ainsi développé une solution complète pour l'analyse et la caractérisation du microbiome cutané.
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Ce que la génomique apporte à notre compréhension du microbiome cutané
La métagénomiquereprésente l'approche la plus complète et innovante pour caractériser et étudier les microbiomes, permettant d'avoir accès à l’ensemble des microorganismes présents dans tout échantillon, et à leur potentiel fonctionnel en identifiant des gènes d’intérêt impliqués dans des voies métaboliques ayant une influence sur la santé de la peau. Dans ce cadre, GenoScreen intervient à différentes étapes de tout projet de recherche et développement sur le microbiome cutané. Nos solutions génomiques couvrent les objectifs suivants :
Pricing
Production de preuves & développement scientifque
Etudes d'impact
Sur le microbiote cutané d'un produit cosmétique ou d'un ingrédient actif
Etudes cliniques
En dermatologie ou dermocosmétique pour évaluer l'effet de traitement sur les pathologies affectant la peau
Objectivation d'actifs
Et preuves de concept des effets de tels ingrédients sur les micro-organismes présents sur l'épiderme
Validation d'allégations
Pour démontrer l'interaction d'un produit avec le microbiome de la peau et mieux comprendre son mode d'action
Projets exploratoires en R&D
Axés sur le microbiome cutané
Pré Pro & Post biotiques
Test d'ingrédients
Collaboration R&D sur létude des communautés microbiennes
Détection de biomarqueurs, analyses ciblées, etc.
Certifications "microbiome friendly"
Confirmant auprès des consommateurs l'innocuité d'un produit cosmétique pour la santé de la peau et l'intégrité de son microbiome
Communication scientifique
Avec des résultats d'études prêts pour leur publication
Nos solutions pour le test et l’analyse du microbiome cutané
De votre question biologique initiale à sa réponse technique, nous mettons en commun notre savoir-faire et nos technologies pour vous apporter la solution la plus adéquate pour répondre aux besoins de votre projet. Principalement réalisées à partir d’échantillons cutanés prélevés sur de l’humain, dans le cadre d’études in vivo , nos analyses peuvent être conduites sur d’autres modèles : peau humaine de synthèse (RHE), explants et culturomique (échantillons in vitro ou ex vivo).
Découvrez nos prestations :
Métagénomique
Métagénomique ciblée « Short read »
La première étape d’analyse du microbiote cutané.
Sur une plateforme de séquençage Illumina, la métagénomique ciblée en short read permet d’obtenir un aperçu global des genres taxonomiques des micro-organismes en présence dans les échantillons issus d’écouvillonnage sur la peau. L’identification de la microflore cutanée repose sur le séquençage de la région 16S de l’ADN ribosomique (rDNA) pour les cibles bactérienne ou sur la région 18S/ITS du rDNA pour les cibles fongiques.
La solution la plus adaptée à l'analyse et la caractérisation du microbiome cutané.
La métagénomique long read permet d’aller plus loin, plus précisément dans l’identification taxonomique, au niveau de l’espèce. Un avantage considérable quand il est question de distinguer les différentes espèces d’importance pour la santé de la peau. Basée sur une plateforme PacBio ou Oxford Nanopore Technologies (ONT), la métagénomique en long read permet également une comparaison plus détaillée entre les échantillons.
Description précise et complète de tous les génomes de micro-organismes dans chaque échantillon.
La métagénomique shotgun offre un potentiel fonctionnel du microbiome cutané, au-delà de la caractérisation de toutes les espèces en une seule analyse comme les procaryotes (bactéries, levures et autres champignons) et les petits eucaryotes. Grâce au séquençage de nouvelle génération (NGS) sur une plateforme Illumina, cette approche non ciblée offre une vision globale des génomes de tous les organismes constituant le microbiote cutané et donne accès à une quantification en valeur relative de leur contenu et de leur proportion dans chaque échantillon. Avec cette technologie, l'annotation des gènes est permise.
Prise en compte de tous les microorganismes en présence (tous domaines, règnes et genres confondus) en une seule analyse
Quantification relative des populations au sein des échantillons
Vue d’ensemble complète du génome du microbiote
Accès au potentiel fonctionnel du microbiome de la peau
Annotation des gènes d’intérêt
Intéressé par nos solutions pour votre projet ?
Contactez-nous en décrivant votre projet !
Nombre d’échantillons Protocole initial (fréquence de prélèvements) Panel sélectionné, objectif (question biologique) Réponse recherchée et technologie associée (quel niveau d’analyse vous intéresse-t-il)
Influence du microbiome cutané sur la santé de la peau
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Comment préserver le microbiote cutané ?
Bioinformatique
Expertise technique
Notre plateforme de bioinformatique base son travail sur des bases de données et des pipelines spécifiques des microbiomes cutanés, développés en interne, et permettant une analyse en profondeur des communautés microbiennes.
Décrypter le microbiome de la peau
Nous fournissons, à travers des rapports interactifs, un panorama complet du microbiote cutané intégrant, entre autres paramètres, les suivants : alpha-diversité et beta-diversité, distance entre les échantillons et comparaison de leur composition.
Interface simple d’utilisation
L’interface est à la fois interactive pour l’utilisateur et d’autre part bâtie dans un format tel qu’il permet son utilisation pour des publications ou de la communication scientifiques, des dossiers réglementaires ou d’études cliniques, tout en rendant son contenu accessible et compréhensible pour l’utilisateur.
Nombre d’échantillons Protocole initial (fréquence de prélèvements) Panel sélectionné, objectif (question biologique) Réponse recherchée et technologie associée (quel niveau d’analyse vous intéresse-t-il)
Influence du microbiome cutané sur la santé de la peau
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Comment préserver le microbiote cutané ?
qPCR
Approches qPCR
La conception et l’ingénierie d’amorces spécifiques à une espèce ou souche composant le microbiome cutané, et de sondes spécifiques pour leur quantification, ce dans divers types d’échantillons : in vivo , ex vivo , in vitro.
La PCR quantitative en temps réel permet une évaluation rapide, robuste et fiable des effets de l’applications de produits de soin de la peau sur le microbiote cutané.
Nombre d’échantillons Protocole initial (fréquence de prélèvements) Panel sélectionné, objectif (question biologique) Réponse recherchée et technologie associée (quel niveau d’analyse vous intéresse-t-il)
Influence du microbiome cutané sur la santé de la peau
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Comment préserver le microbiote cutané ?
GenoBiome®
GenoBiome® Skin
Solution globale d’analyse du microbiome cutané, adaptable à chaque projet, à partir d’échantillons prélevés in vivo. Un large panel de solutions d’analyses génomiques bénéficiant de l’accompagnement et de l'expertise de notre équipe de microbiologistes et de bioinformaticiens. GenoBiome® Skin est basé sur un pipeline complet, du design du protocole expérimental
avec nos experts, en passant par le séquençage et le traitement des données en bioinformatique, jusqu'au rendu et à l'interprétation des résultats. Parmi la gamme de réponses technologiques pouvant s’appliquer dans le cadre de GenoBiome® Skin, on retrouve notre portefeuille métagénomique ainsi que l'analyse personnalisée de souches spécifiques.
GenoBiome® Skin constitue à ce jour la solution la plus avancée pour vous accompagner dans vos projets de recherche et de développement sur le microbiote de la peau.
Fourniture de matériel de prélèvement (écouvillons, swabs)
Bases de données et outils bioinformatiques spécialisés pour analyser le microbiome cutané
Pipeline d’analyse sur mesure, avec des méthodes d’extractions pour les biomasses rares et une stratégie de séquençage optimisée
Rapports interactifs, prêts à être publiés
Interprétation des résultats : plus que des données de séquençage, nous donnons des réponses à vos questions biologiques
Protocole de conservation et d’expédition des échantillons
Accompagnement tout au long de votre projet, jalonnés par des rendez-vous de suivi réguliers
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