Chez GenoScreen, nous transformons les données métagénomiques en insights exploitables, grâce à des analyses sur mesure et un accompagnement scientifique de pointe.

 

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Pourquoi choisir la métagénomique ?

La métagénomique permet d’analyser la diversité et le fonctionnement des communautés microbiennes directement dans leur environnement, sans culture préalable. Elle offre une compréhension approfondie de la composition, des interactions et des fonctions du microbiome, ouvrant la voie à des applications majeures en santé humaine et animale, dermocosmétique, environnement et biotechnologies industrielles.

 

Slide 1
GenoScreen - +20 ans d'expérience en génomique & métagénomique
+20 ans
d'expérience

en génomique
& métagénomique

La métagénomique : notre expertise

Notre expérience nous a aidé à développer et à affiner des méthodologies robustes et adaptées à la singularité de chaque type d'échantillon, garantissant ainsi la pertinence et la fiabilité de vos résultats.

Vous serez accompagné(e) par une équipe multidisciplinaire d'experts en bioinformatique et microbiologie, assurant une prise en charge complète et personnalisée de votre projet.

L'assurance qualité au cœur de notre démarche

Nous avons mis en place un système de contrôle qualité interne systématique et exhaustif permettant de valider la performance de nos protocoles et d'assurer l'intégrité de vos résultats.

Vous bénéficierez de résultats clairs et interactifs, conçus pour une compréhension approfondie et une exploitation optimale de vos données.

GenoScreen - L'assurance qualité au cœur de notre démarche
Conformité
aux normes GCLP

analyses rigoureuses
& traçables

Des méthodologies adaptées à chaque type d’échantillon

Chaque matrice biologique ou environnementale est unique et nécessite une approche spécifique. Grâce à notre expertise, nous avons développé des protocoles optimisés pour différentes matrices :

Microbiote intestinal
Microbiote intestinal
Microbiote cutané
Microbiote cutané
Microbiote des sols
Microbiote des sols
Autres matrices
Autres matrices

Autres matrices ? Notre expérience nous permet d’adapter nos méthodologies à une large variété d’échantillons. Discutons-en ensemble !

Notre workflow appliquée à la métagénomique

Extraction ADN optimisée pour chaque matrice

selles, sols, peau, fermentés, etc.

Préparation des librairies

avec contrôles qualités intégrés

Séquençage haut-débit adapté

Analyse bioinformatique

Interprétation & Restitution

Extraction ADN optimisée pour chaque matrice

Extraction ADN optimisée pour chaque matrice

selles, sols, peau, fermentés, etc.

Préparation des librairies

Préparation des librairies

avec contrôles qualités intégrés

Séquençage haut-débit adapté

Séquençage haut-débit adapté

Analyse bioinformatique

Analyse bioinformatique

Interprétation & Restitution

Interprétation & Restitution

Pricing
Notre différence : des analyses maîtrisées de bout en bout
Contrôle qualité

Un contrôle négatif est systématiquement inclus pour détecter les contaminations croisées et garantir l’intégrité des analyses. Chaque série comporte également un contrôle positif (communauté microbienne standardisée) permettant de valider la préparation des échantillons, de calibrer les outils bioinformatiques, et d’évaluer la sensibilité et la spécificité des pipelines analytiques.

Rendus exploitables

Rendus compréhensibles et commentés par nos experts PhD. Possibilité de restitution orale pour contextualiser les résultats, quel que soit votre niveau en bioinformatique.

 

Plus de technologies, plus de personnalisation

Nous proposons des technologies de séquençage ADN entièrement adaptées à vos objectifs analytiques : Illumina (short-read) pour des lectures précises à haut débit, et PacBio (long-read) pour une résolution longue, idéale pour la caractérisation fine des génomes microbiens.

Selon le niveau d’analyse souhaité, nos protocoles sont disponibles en métabarcoding (16S, 18S, ITS) pour une approche ciblée, ou en shotgun métagénomique pour une exploration exhaustive de la diversité microbienne, tant taxonomique que fonctionnelle.

De plus, la profondeur de séquençage est ajustée en fonction de vos besoins spécifiques, en tenant compte de la richesse et de la complexité du microbiote étudié (qu’il soit d’origine humaine, animale, végétale ou environnementale).

 

First-Res

First-Res

Métabarcoding (Illumina)

Type d'analyse

Séquençage ciblé
Régions 16S/18S/ITS

Applications principales

Identification globale des micro-organismes (Genre)

Objectifs principaux

Identification globale des micro-organismes présents dans un échantillon.

Technologie utilisée

Séquençage ciblé de l’ADN ribosomique (16S/18S/ITS) avec la technologie Illumina (short reads).

Exemples d’applications

Études d’impact du microbiote intestinal humain et animal après traitement de probiotiques.
Analyse de la biodiversité des sols en fonction des pratiques agricoles.

Hi-Res

Hi-Res

Métabarcoding (PacBio)

Type d'analyse

Séquençage ciblé
16S pleine longueur

Applications principales

Résolution taxonomique fine (Espèce)

Objectifs principaux

Résolution taxonomique affinée, jusqu’au niveau de l’espèce.

Technologie utilisée

Séquençage long-read (PacBio) des gènes complets rDNA 16S ou 18S pour une reconstitution plus complète des génomes microbiens.

Exemples d’applications

Étude du microbiote cutané pour la dermocosmétique.
Analyse du microbiome des sols pour la restauration écologique.

Full Reveal

Full Reveal

Métagénomique Shotgun (Illumina)

Type d'analyse

Analyse taxonomique et fonctionnelle

Applications principales

Séquençage des génomes microbiens complets

Objectifs principaux

Résolution taxonomique ultra-fine (au-delà de l’espèce).
Analyse complète du potentiel fonctionnel des communautés microbiennes.
Détection des gènes d’intérêt (antibiorésistance, virulence, métabolisme).

Technologie utilisée

Séquençage ciblé de l’ADN ribosomique 16S/18S/ITS, par la technologie Illumina short-read.

Exemples d’applications

Études d’impact du microbiote intestinal humain et animal après traitement de probiotiques.
Analyse de la biodiversité des sols en fonction des pratiques agricoles.

Activ' Reveal

Activ' Reveal

Métagénomique + Métatranscriptomique (Illumina)

Type d'analyse

Analyse combinée ADN & ARN

Applications principales

Étude des fonctions microbiennes actives

Objectifs principaux

Comprendre quelles fonctions microbiennes sont actives à un instant donné.
Identifier les voies métaboliques clés en réponse à un stress ou traitement.

Technologie utilisée

Séquençage combiné ADN (métagénomique) et ARN (métatranscriptomique).

Exemples d’applications

Étude de l’effet des prébiotiques et probiotiques sur le microbiote intestinal.

Pricing
L'expérience GenoScreen en quelques mots...

Du montage de votre projet au rendu des résultats

Méthodes et solutions adaptées à vos projets

Etudes micro-organismes depuis plus de 20 ans

Support au-delà du rendu des résultats

"matériels et méthodes" explicitées