GenoScreen vous propose de caractériser plus précisément vos microorganismes (caractérisation de la sous-espèce ou de la souche) à l’aide de méthodes de biologie moléculaire standardisées et validées de type MLST (MultiLocus Sequencing Typing) ou MLVA (Multiple Loci VNTR Analysis).

L'analyse peut être réalisée sur la base d’un schéma de typage personnalisé selon vos besoins.

GenoScreen est le leader mondial pour le génotypage des souches du complexe Mycobacterium tuberculosis, agent responsable de la tuberculose, au travers de ses solutions MIRU-VNTR, disponibles en kit et en services.

GenoScreen propose également le séquençage de génome complet (WGS) et l'approche complémentaire par spoligotypage pour une caractérisation plus précise de vos microorganismes.

 

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Souches caractérisées par la méthode de typage MLST (liste non exhaustive)

Règne / KingdomClasse / ClassOrdre / OrderEspèce / Species
AnimaliaMyxozoaMultivalvulidaKudoa septempunctata
AnimaliaRhabditophoraPlagiorchiidaClonorchis sinensis
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesCorynebacterium diphtheriae
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesCutibacterium acnes
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesMycobacterium abscessus complex
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesMycobacterium spp.
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesRhodococcus equi
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesStreptomyces spp.
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesBartonella bacilliformis
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesBartonella henselae
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesBartonella washoensis
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesBrucella spp.
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesCandidatus Liberibacter solanacearum
BacteriaAlpha ProteobacteriaRhizobialesSinorhizobium spp.
BacteriaAlpha ProteobacteriaRickettsialesAnaplasma phagocytophilum
BacteriaAlpha ProteobacteriaRickettsialesOrientia tsutsugamushi
BacteriaAlpha ProteobacteriaRickettsialesWolbachia spp.
BacteriaBacilliBacillalesBacillus cereus
BacteriaBacilliBacillalesBacillus licheniformis
BacteriaBacilliBacillalesBacillus subtilis
BacteriaBacilliBacillalesMacrococcus canis
BacteriaBacilliBacillalesMacrococcus caseolyticus
BacteriaBacilliBacillalesPaenibacillus larvae
BacteriaBacilliBacillalesStaphylococcus aureus
BacteriaBacilliBacillalesStaphylococcus epidermidis
BacteriaBacilliBacillalesStaphylococcus haemolyticus
BacteriaBacilliBacillalesStaphylococcus hominis
BacteriaBacilliBacillalesStaphylococcus pseudintermedius
BacteriaBacilliLactobacillalesCarnobacterium maltaromaticum
BacteriaBacilliLactobacillalesEnterococcus faecalis
BacteriaBacilliLactobacillalesEnterococcus faecium
BacteriaBacilliLactobacillalesLactobacillus salivarius
BacteriaBacilliLactobacillalesMelissococcus plutonius
BacteriaBacilliLactobacillalesPediococcus pentosaceus
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus agalactiae
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus anginosus
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus bovis complex
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus canis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus dysgalactiae
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus equinus complex
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus faecalis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus gallolyticus
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus gordonii
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus mitis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus mutans
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus oralis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus pneumoniae
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus pyogenes
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus salivarius
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus suis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus thermophilus
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus uberis
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus viridans
BacteriaBacilliLactobacillalesStreptococcus zooepidemicus
BacteriaBacteroidetesPorphyromonadaceaePorphyromonas gingivalis
BacteriaBeta ProteobacteriaBurkholderialesAchromobacter
BacteriaBeta ProteobacteriaBurkholderialesBordetella spp.
BacteriaBeta ProteobacteriaBurkholderialesBurkholderia cepacia complex
BacteriaBeta ProteobacteriaBurkholderialesBurkholderia pseudomallei
BacteriaBeta ProteobacteriaBurkholderialesTaylorella spp.
BacteriaBeta ProteobacteriaNeisserialesNeisseria spp.
BacteriaChlamydiaeChlamydialesChlamydiales spp.
BacteriaClostridiaClostridialesClostridioides difficile
BacteriaClostridiaClostridialesClostridium botulinum
BacteriaClostridiaClostridialesClostridium septicum
BacteriaEpsilon ProteobacteriaCampylobacteralesArcobacter spp.
BacteriaEpsilon ProteobacteriaCampylobacteralesCampylobacter spp.
BacteriaEpsilon ProteobacteriaCampylobacteralesHelicobacter cinaedi
BacteriaEpsilon ProteobacteriaCampylobacteralesHelicobacter pylori
BacteriaEpsilon ProteobacteriaCampylobacteralesHelicobacter suis
BacteriaFlavobacteriaFlavobacterialesFlavobacterium psychrophilum
BacteriaFlavobacteriaFlavobacterialesOrnithobacterium rhinotracheale
BacteriaFlavobacteriaFlavobacterialesRiemerella anatipestifer
BacteriaFlavobacteriaFlavobacterialesTenacibaculum spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaAeromonadalesAeromonas spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaCardiobacterialesDichelobacter nodosus
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesCitrobacter freundii
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesCronobacter spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesEdwardsiella spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesEnterobacter cloacae
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesEscherichia spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesKlebsiella aerogenes
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesklebsiella michiganensis
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesKlebsiella oxytoca
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesSalmonella spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesYersinia pseudotuberculosis
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesYersinia ruckeri
BacteriaGamma ProteobacteriaEnterobacterialesYersinia spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaPasteurellalesGallibacterium anatis
BacteriaGamma ProteobacteriaPasteurellalesHaemophilus influenzae
BacteriaGamma ProteobacteriaPasteurellalesHaemophilus parasuis
BacteriaGamma ProteobacteriaPasteurellalesMannheimia haemolytica
BacteriaGamma ProteobacteriaPasteurellalesPasteurella multocida
BacteriaGamma ProteobacteriaPseudomonadalesAcinetobacter baumannii
BacteriaGamma ProteobacteriaPseudomonadalesMoraxella catarrhalis
BacteriaGamma ProteobacteriaPseudomonadalesPseudomonas aeruginosa
BacteriaGamma ProteobacteriaPseudomonadalesPseudomonas fluorescens
BacteriaGamma ProteobacteriaPseudomonadalesPseudomonas putida
BacteriaGamma ProteobacteriaThiotrichalesPiscirickettsia salmonis
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesPhotobacterium damselae
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesVibrio cholerae
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesVibrio parahaemolyticus
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesVibrio spp.
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesVibrio tapetis
BacteriaGamma ProteobacteriaVibrionalesVibrio vulnificus
BacteriaGamma ProteobacteriaXanthomonadalesStenotrophomonas maltophilia
BacteriaGamma ProteobacteriaXanthomonadalesXylella fastidiosa
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma agalactiae
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma bovis
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma flocculare
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma hominis
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma hyopneumoniae
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma hyorhinis
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma iowae
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma pneumoniae
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesMycoplasma synoviae
BacteriaMollicutesMycoplasmatalesUreaplasma spp.
BacteriaSpirochaetesBrachyspiralesBrachyspira spp.
BacteriaSpirochaetesLeptospiralesLeptospira spp.
BacteriaSpirochaetesSpirochaetalesBorrelia spp.
BacteriaSpirochaetesSpirochaetalesTreponema pallidum subsp. pallidum
ChromistaOomycotaSaprolegnialesSaprolegnia parasitica
ExcavataParabasaliaTrichomonadidaTrichomonas vaginalis
FungiBlastocystaeBlastocystidaBlastocystis sp.
FungiEurotiomycetesEurotialesAspergillus fumigatus
FungiSaccharomycetesSaccharomycetalesCandida albicans
FungiSaccharomycetesSaccharomycetalesCandida glabrata
FungiSaccharomycetesSaccharomycetalesCandida krusei
FungiSaccharomycetesSaccharomycetalesCandida tropicalis
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Souches caractérisées par la méthode de typage MLVA (liste non exhaustive)

Règne / KingdomClasse / ClassOrdre / OrderEspèce / Species
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesMycobacterium tuberculosis
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesMycobacterium bovis
BacteriaActinobacteriaActinomycetalesMycobacterium avium
BacteriaGamma ProteobacteriaThiotrichalesFrancisella tularensis
FungiSaccharomycetesSaccharomycetalesSaccharomyces cerevisiae

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