Les biotiques — qu’ils soient prébiotiques, probiotiques ou postbiotiques — sont au cœur des stratégies nutritionnelles et thérapeutiques visant à préserver ou restaurer l’équilibre du microbiote intestinal. Mais face à des exigences réglementaires croissantes (EFSA, FDA) et à un marché de plus en plus compétitif, il est indispensable de documenter leur efficacité avec des données scientifiques robustes.
Un biotique est défini par sa capacité à interagir avec le microbiote et l’hôte. Étudier le microbiote permet :
- D’identifier des souches candidates (probiotiques issus de microbiotes sains)
- De valider des effets cibles (rétablissement de la diversité, activation de fonctions bénéfiques)
- De documenter scientifiquement les bénéfices d’un produit, en lien avec les exigences des autorités réglementaires
L’efficacité d’un probiotique s’évalue à deux niveaux :
- Cliniquement, via des effets mesurables chez les sujets (digestion, immunité, inflammation, etc.)
- Biologiquement, via des analyses du microbiote montrant une modification structurelle ou fonctionnelle après administration
Les approches de métagénomique ciblée ou globale (solutions First-Res et Full Reveal) permettent de mettre en évidence ces modifications dans des études in vitro, in vivo ou cliniques.
L’impact peut être mesuré par :
- Une analyse des espèces microbiennes présentes (composition du microbiote)
- L’étude des gènes et fonctions associés (ex. : production d’AGCC, régulation de l’inflammation)
Ces données sont obtenues via la métagénomique pour les espèces et les fonctions codées, et via la métatranscriptomique pour les fonctions réellement exprimées (solution Activ’Reveal).
Oui, grâce à des outils ciblés comme la qPCR spécifique (solution iQuant), on peut :
- Détecter une souche d’intérêt dans un microbiote complexe
- Quantifier son abondance
- Distinguer cellules vivantes et mortes (par traitement PMA)
C’est indispensable pour vérifier la persistance d’un probiotique dans le microbiote, ou pour des contrôles qualité dans le produit fini.



