L'offre GENO SNP

Découverte de marqueurs

Nous fournissons des conseils personnalisés et des solutions pour l'identification de variants génétiques comme les Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) n'importe qu'elle espèce et à toute échelle.

La plateforme de technologie RAD-Seq permet de personnaliser l'approche moléculaire afin d'obtenir une solution optimale à coûts réduits pour tout type et toute taille de projet.

Les résultats de ces projets de recherche de marqueurs SNPs sont fournis dans un format qui peut être facilement convertit pour intégration ultérieure sur des plateformes de génotypage comme Golden Gate™, iPLEX™, KaSP™, and TaqMan™.

 

Chaque Projet comprend:

 

  • Support Client
  • Nombre d'échantillons flexible
  • Procédures QA/QC
  • Préparation des librairies RAD
  • Séquençage sur HiSeq 2500 (Illumina)
  • Analyses Bioinformatiques :
    • Contrôle qualité du séquençage
    • Démultiplexage des index
    • Assemblage De novo
    • Alignement
    • Dénomination des variants
  • Délai de livraison : environ 12 à 16 semaines
  • Stockage des données jusqu'à 1 an

 

floragenex discovery

  


 

Génotypage

Nos solutions de génotypage sont adaptées pour les clients souhaitant rapidement identifier une grande quantité de variations génétiques, étape pouvant constituer une partie intégrante d'un projet de recherche. Contrairement aux anciennes solutions de génotypage, nous fournissons une solution de génotypage basée sur un procédé en une seule étape, nous permettant d'obtenir à la fois les banques de marqueurs et le génotypage. Plusieurs types de solutions de génotypage sont disponibles en fonction des besoins des clients et du degrés de support désiré.

 

Pack Premium

  • Traitement personnalisé de 24 à 384 (et +) échantillons (par lots de 8)
  • Support & conseils personnalisés
  • Définition & Montage de Projet (ex choix des enzymes)
  • Séquençage sur HiSeq 2500 (Illumina) inclus
  • Support Informatique optimum :
    • Séquençage QA/QC
    • Démultiplexage des échantillons
    • Trimming des reads (coupures adaptées des extrémités)
    • Alignement
    • Dénomination des variants
    • Analyse du Génotypage
  • Données de Séquences convertibles en formats VCF, JoinMap™, IUPAC ou autres formats de génotypage
  • Délai de livraison : 12 à 16 semaines environ
  • 12 mois d'accès aux données 

 

floragenex genotyping premium

 

Pack Classique

Le Pack Classique permet de produire des RAD Sequences de haute qualité à moindre coûts. Ce Pack a été conçu pour les scientifiques déjà initiés aux techniques de Séquençage nouvelle génération et qui n'ont donc pas besoin d'un support poussé comme celui proposé dans le Pack Premium.

  • Traitement par lots de 95 échantillons
  • Choix des techniques de préparation des libraries RAD avec SbfI ou PstI
  • Séquençage des libraries sur une ligne Illumina HiSeq 2500 (1x100 pb avec ~125 Millions de reads passant les filtres)
  • Délai de livraison rapide : environ 12 à 14 semaines

floragenex genotyping value

 

Quel Pack Choisir ? 

Comparaison des Packs :

floragenex genotyping comparison

 


 

Prestations Analytiques

 

Les clients interessés par une interprétation de leurs résultats peuvent accéder à une expertise interne de pointe en matière d'analyse. Au cours des années et à travers des centaines de projets de recherche, Floragenex a acquis une grande expertise en matière d'analyse des données issues des technologies RAD-Seq.

Floragenex fournit ainsi un support personnalisé de grande qualité pour une publication à forte valeur ajoutée dans des délais réduits.

 

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