Geno Sat : Banques et génotypage de microsatellites
Production de banques de microsatellites par séquençage haut débit
Une méthode standardisée
Basée sur le séquençage haut débit, la technique* a été validée sur 160 banques différentes séquencées chez Genoscreen.
Une efficience record
A partir d’1 µg d’ADN génomique, cette technologie permet d’obtenir un minimum de 8 000 séquences et 100 couples de primers validés encadrant des motifs microsatellites dans un délai record de 2 mois.
Une offre modulable
En fonction de vos objectifs, Genoscreen vous apporte une solution simple et attractive: Geno Sat pour la production de la banque, Geno Sat Pack qui comprend également la validation des marqueurs polymorphes, et Geno Sat Pack Plus qui intégre le génotypage à partir des marqueurs identifiés.
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Geno Sat
Genoscreen vous propose une solution de création de banques de microsatellites, avec un accompagnement de A à Z :
- Production de marqueurs microsatellites par clonage et séquençage capillaire (3730XL®, Applied Biosystems®) et par pyroséquençage à ultra haut-débit (GS FLX®, Roche Diagnostics®)
- Mise au point et validation de marqueurs microsatellites par analyse de fragments sur séquenceur capillaire (3730XL®, Applied Biosystems®)
- Génotypage de marqueurs microsatellites par analyse de fragments sur séquenceur capillaire (3730XL®, Applied Biosystems®)
Nous vous proposons la définition les conditions optimales d'analyse des microsatellites, la réalisation des PCR multiplexées, puis le génotypage des échantillons sur séquenceur capillaire. Nous pouvons également réaliser l'analyse associée.
- Fourniture du marqueur de taille
- Intégration des contrôles qualité
- Stockage des échantillons mères pendant 4 semaines
- Combinaisons de fluorophores possibles : FAM-VIC/HEX-PET-NED ou FAM-HEX-NED-ROX
- Confidentialité des informations reçues et résultats obtenus
Geno Sat Pack
Geno Sat + Validation biologique des couples de primers et identification des marqueurs microsatellites polymorphes sur un échantillonnage représentatif de la variabilité génétique intra-spécifique
Geno Sat Pack Plus
Geno Sat Pack + Génotypage sur une large population d’individus à partir des marqueurs validés.
* Procédé GENOSCREEN – INRA – Montpellier SUPAGRO– Université de Provence.
