Assemblage et annotation de génomes
Genoscreen vous accompagne en bioinformatique pour le traitement de vos données de séquençage ultra haut débit.
Notre équipe vous propose différents niveaux d'analyse pour obtenir le meilleur de vos données, grâce à un travail en profondeur:
- Assemblage de génomes complets procaryotes et eucaryotes: mapping ou assemblage "de novo", création d'une banque de gènes ou d'une base de données de référence
- Annotation structurelle et fonctionnelle du génome
- Comparaison des échantillons
- Prédiction ou annotation manuelle par recherche de similarité et prédiction de structure
Offre à la une: Assemblage rapide de génomes 454 et Hiseq 2000, dès 150 € / génome en 48h*
- Assemblage de génomes bactériens
- Assemblage de toutes données 454 et Hiseq
- Assemblage de tous génomes
A partir de données .fna et .qual pour 454, et de données .fastQ et .fastA pour Hiseq.* Prix unitaire hors taxes. Offre valable pour un maximum de 10 génomes bactériens séquencés sur 454.
Notre offre:
- Alignement
- Comparaison
- Interprétation: longueur des zones chevauchantes, couverture de la référence en % d'homologie, nombre de contigs, nombre de scaffolds (paired-end)
- Envoi du rapport d'interprétation et des résultats d'alignement sur serveur ftp