Projets en cours
Application aux maladies neurodégénératives:
Recherche de facteurs de susceptibilité génétiques et protéiques des maladies chroniques dégénératives (Alzheimer, 3 brevets déposés). Les objectifs sont l'identification de clés moléculaires pour la susceptibilité et le diagnostic, proposition de thérapies innovantes en termes de pharmacogénétique. Genoscreen est coordinateur du projet collaboratif MEDIALZ qui vise à la création et à la pérennisation d’un centre de référence, capable d’optimiser et d’accélérer la recherche sur la maladie d’Alzheimer et la valorisation et le transfert de cette recherche vers le patient, à court et long terme. Projet sélectionné à l’issue du 9ème appel à projets de R&D du FUI.et labellisé par le Pôle NSL. Partenaires MEDIALZ: Genoscreen, Alzprotect, Inserm U744-3, Inserm U837-1 et CMRR Lille-Bailleul.
Développement d'outils de microbiologie moléculaire:
Mise au point de méthodes et de kits de typage et de caractérisation de micro-organismes pathogènes en collaboration avec des cliniciens et des partenaires académiques. Développement d’un kit de typage des mycobactéries par MIRU-VNTR avec l’ INSERM U629.
Genoscreen est partenaire du projet européen Patho-NGen-Trace (qui va se dérouler sur 5 ans), qui vise à exploiter les technologies de Séquençage Nouvelle Génération, depuis la recherche fondamentale jusqu’à la création d’outils pour la microbiologie médicale et industrielle.
Les travaux s’intéresseront plus spécifiquement à Mycobacterium tuberculosis complex, Staphylococcus aureus et Campylobacter spp et comporteront des développements bioinformatiques importants.
Le consortium européen regroupe Genoscreen, Applied Maths (Belgique), Ridom (Allemagne), Piext BV (Pays-Bas), Eurice (Allemagne), le Borstel Research Center (Allemagne), la West-fälische Wilhelms-Universität Münster (Allemagne), et l’université d’Oxford (UK).
Bioinformatique :
Développement de logiciels adaptés aux analyses génétiques (MIRU-VNTR Data Manager) -Annotation des génomes procaryotes pour la prédiction d'opéron - Génomique comparative - Transcriptomique…
Biodiversité :
Mise au point d’une méthode de production de banques de marqueurs microsatellites basée sur le séquençage haut débit. La technique* a été validée sur 160 banques différentes séquencées chez Genoscreen. A partir d’1 μg d’ADN génomique, cette technologie permet d’obtenir un minimum de 8000 séquences dans un délai record d’un mois et demi.
* Procédé GENOSCREEN – INRA – Montpellier SUPAGRO– Université de Provence.
Métagénomique ciblée à partir d’échantillons de d'eau, de terre, de crachats, de tissus, de fèces, d'aliments…
