Publications 2008

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Laboratoire partenaire : Laboratoire INSERM U629 - Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne (LILLE)

Thibault VC, Grayon M, Boschiroli ML, Willery E, Allix-Béguec C, Stevenson K, Biet F, Supply P.
Combined multilocus short-sequence-repeat and mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem-repeat typing of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates.

J Clin Microbiol. 2008 Dec;46(12):4091-4.

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Laboratoire partenaire : Département de Bactériologie, Hôpital Robert Debré (PARIS)

Mahjoub-Messai F, Doit C, Koeck JL, Billard T, Evrard B, Bidet P, Hubans C, Raymond J, Levy C, Cohen R, Bingen E.
Population Snapshot of Streptococcus pneumoniae Serotype 19A Isolates before and after the Introduction of 7-valent Pneumococcal Vaccination in French Children.

J Clin Microbiol. 2008 Dec 24.

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Laboratoire partenaire : Laboratoire INSERM U629 - Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne (LILLE)

Wirth T, Hildebrand F, Allix-Béguec C, Wölbeling F, Kubica T, Kremer K, van Soolingen D, Rüsch-Gerdes S, Locht C, Brisse S, Meyer A, Supply P, Niemann S.
Origin, spread and demography of the Mycobacterium tuberculosis complex.

PLoS Pathog. 2008 Sep 19;4(9):e1000160.

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Laboratoire partenaire : Laboratoire INSERM U629 - Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne (LILLE)

Allix-Béguec C, Harmsen D, Weniger T, Supply P, Niemann S.
Evaluation and strategy for use of MIRU-VNTRplus, a multifunctional database for online analysis of genotyping data and phylogenetic identification of Mycobacterium tuberculosis complex isolates.

J Clin Microbiol. 2008 Aug; 46(8):2692-9. 

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Laboratoire partenaire : Laboratoire INSERM U629 - Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne (LILLE)

Allix-Béguec C, Supply P, Wanlin M, Bifani P, Fauville-Dufaux M.
Standardised PCR-based molecular epidemiology of tuberculosis.

Eur Respir J. 2008 May;31(5):1077-84.

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Laboratoire partenaire : Laboratoire INSERM U629 - Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne (LILLE)

Allix-Béguec C, Fauville-Dufaux M, Supply P.
Three-year population-based evaluation of standardized mycobacterial interspersed repetitive-unit-variable-number tandem-repeat typing of Mycobacterium tuberculosis.

J Clin Microbiol. 2008 Apr;46(4):1398-406.

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Laboratoire partenaire : Laboratoire de Biopuces IPL (LILLE)

C. Hubans, D. Hot, L. Huot, B. Wulbrecht, M. Chahed, E. Mephu-Nguifo and Y. Lemoine. '
Ab initio' operon predictions using intergenic region discrimination based on nucleotide composition analyses.

BMC Bioinformatics 2008.