Le métatranscriptome représente l’ensemble des gènes et les fonctions exprimées (les transcriptomes) par les différents microorganismes d’un échantillon.

Les applications

La métatranscriptomique ouvre de nombreux champs d’analyse :

  • Identification de fonctions enzymatiques et voies métaboliques exprimées
  • Comparaison des niveaux d’expression de gènes entre échantillons ou conditions expérimentales
  • Identification des microorganismes impliqués dans l’expression des voies métaboliques d’intérêt

L’offre GenoScreen

Les équipes de GenoScreen peuvent intervenir dès la matrice initiale en extrayant les ARN produits par l’ensemble des microorganismes.

Les méthodologies de préparation de librairies sont ensuite adaptées aux objectifs de recherche et à la nature de la matrice initiale :

  • Pour les eucaryotes
    • Enrichissement spécifique des ARN messagers polyadénylés
  • Pour les bactéries
    • Élimination des ARN messagers polyadénylés eucaryotes
    • Soustraction des ARN ribosomaux très majoritairement exprimés

L’avantage GenoScreen

  • Accompagnement complet du prélèvement des échantillons initiaux à la préparation des librairies RNA-seq
  • Stratégies de séquençage sur-mesure (nombre de vos échantillons, longueur des séquences, etc)
  • 15 ans d'expertises sur l'analyse des ARNs
  • Une expertise en transcriptomique

 

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